Научный архив ИКИАТ создан в апреле 2008 года в целях комплектования, обеспечения сохранности, государственного учета и упорядочения архивных документов и материалов учреждения.

Заведующий научным архивом института - Авеева Б.М.

Материалы научного архива - это научные работы, экспедиционные и тематические отчеты, первичные рабочие материалы, документы по личному составу, документы научно-организационного характера и финансово-бухгалтерские дела. В настоящее время в архиве находится 643 единицы дел постоянного и временного хранения.